保持配水系統中良好的水質，要依靠該系統的設計和操作，也要依靠維護和檢查，以防 止污染并去除內部沉積物的積累。
１）有害物識別
保護輸配水系統對提供安全飲用水十分重要。輸配水系統可能包括很多千米長的管 道、儲水罐與工業用戶的交叉口，輸配水系統還有被損毀和破壞的可能性，還存在微生物和 化學物質污染的機會。
當輸配水系統內發生腸道病原體或者有害化學物質污染時，消費者便很可能暴露于這 些危害中。比如病原體的侵入，即使尚有殘留的消毒劑能限制微生物生長，但可能不足以克 服污染，或對進入的部分或全部類型的病原體無效。最終存留的病原體可能引發感染并 致病。 在間歇性供水地方，低水壓會使污染水通過管道破損、裂縫、連接處和微孔進入系統中。 我們不希望采用間歇供水，但這在許多國家卻很普遍，而且經常導致污染事故。
在間歇供水 過程中控制水質問題是一大難題，因為滲透和回流的危險性顯著增加。這種危險性可能因 季節變化而增高，土壤濕度可能增加土壤和管道之間的壓力梯度。在間歇性供水中若污染 物進入管道，當恢復供水時，給系統補充的水會增加消費者的危險性。可以預料，被污染的 水會給該供水系統一次集中的沖擊。當使用家庭儲水來克服間歇供水的問題時，局部加消毒劑以減少微生物增殖的做法可能對安全是有保證的。
進入輸配水系統的飲用水可能含有非寄生的阿米巴原蟲和各種異養細菌的環境品系以及 真菌。在適宜的條件下，阿米巴和異養菌，包括檸檬酸桿菌、腸桿菌和克雷伯桿菌，可能在輸配 水系統中生長并形成生物膜。現在還不能證明在生物膜上的大多數微生物（軍團菌例外，能 在建筑給水系統中繁殖）會通過飲用水對一般人群的健康產生不良作用，但也可能對嚴重免 疫受損的人來說是例外。
輸配水系統中的溫度和營養物濃度一般不會達到能支持生物膜上大腸埃希氏菌（或腸 道病原菌）的生長。因此，大腸埃希氏菌的存在是新近受到糞便污染的證明。
自然災害，包括洪水，干旱和地震會嚴重影響管網輸配水系統。
２）控制措施
進入輸配水系統的水必須在微生物方面是安全的，理想的應該在生物學上也是穩定的。 輸配水系統本身必須對輸送給用戶的水提供一道防污染的安全屏障。保持整個輸配水系統 中有消毒劑殘留可以防止再污染，并限制微生物生長。已證明加入氯胺能成功控制長距離 管線的沉積物中和水中的福氏耐格里阿米巴原蟲，并可能減少建筑物內軍團菌再生長。
殘留消毒劑可對微生物污染提供部分防護，但它也可能掩蓋本應由常規糞便指示菌，如 大腸埃希氏菌等污染指示菌的檢出，特別是對抵抗力強的生物體的檢出。當輸配水系統中 殘留消毒劑時，應該考慮如何使產生的消毒副產物減至最低。
輸配水系統應該完全密閉，儲水池和水罐應保證有頂蓋并有外部排水以防污染，并避免 短路。水的儲存和配送中均要防止水的停滯不動，以免微生物生長。有許多措施可用來保 持輸配水系統內的水質，包括采用防止回流裝置、保持整個系統正壓和實施有效維護等。用 適當安全措施來防止未經準許的接觸和干擾飲用水系統的基礎設施。
? 控制措施還包括采用更穩定的二級化學消毒劑（如氯胺替代游離氯），制訂管道更換規 劃，沖洗和維修，保持輸配水系統正壓等。避免水在儲水罐、在回路和末端停滯不動，減少水 在系統中的停留時間，這些對維護飲用水水質也是有好處的。
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